Наиболее часто встречающейся в Веб гипертекстовой структурой является форма дерева или иерархии. Хотя иерархия может не обеспечивать пространственной структуры, присущей решетке, или предсказуемости и управляемости линейной структуры, она необычайно важна, т. к. может быть модифицирована для того, чтобы скрыть или показать столько информации, сколько необходимо. Иерархии начинаются с корневой страницы, которая часто является домашней страницей сайта или раздела. Домашняя или корневая страница дерева сайта служит в качестве страницы-ориентира, т. к. часто сильно отличается по внешнему виду от других страниц сайта. Ориентиры сайта, такие как домашние страницы, являются ключом к созданию успешной навигации. Они будут обсуждаться в следующей главе. Для перехода с домашней страницы представлены различные варианты выбора. По мере продвижения пользователя в глубь сайта варианты выбора становятся все более специфичными, пока не приведут к пункту назначения или конечной странице в дереве исследуемого сайта. По этой причине существует тенденция описывать деревья с позиций их глубины и ширины.